演員:松本潤 鈴木杏 いかりや長介 雛形あきこ 伊武雅刀 伊藤高史 室井滋 酒井若菜 成宮寬貴 綾瀨遙 山田優 內藤剛志 長谷川純
導演:下山天 佐藤東彌 長沼誠
劇情: 在旅行的列車上,美雪(鈴木杏 飾)再次邂逅了金田一(松本潤 飾),並追隨於他。同伴用手中的DV記錄著發生的一切。某夜,一個木偶團長不幸被害。案發後,警探發現他原本在車廂裡的屍體不翼而飛,於是引起了一陣騷亂。探長決定在一家酒店暫時住下,找尋犯罪嫌疑人,金田一等人也一同前往。後來,根據案情,嫌疑人被鎖定在木偶團體成員之中,探長想通過體重以縮小搜查範圍。但是,一個女成員的意外死亡,卻讓金田一發現了隱藏的秘密,並由此揭開了一樁塵封多年的舊案真相…… 本片根據天樹徵丸的漫畫改編,除上述特別版魔術列車殺人事件外,還包括以下6個事件,分別為幽靈客船殺人事件、法蘭西銀幣殺人事件、黑死蝶殺人事件、速水玲香誘拐殺人事件、魔術的森殺人事件和露西亞人形殺人事件。